Die Geschäftsleitung besteht aus neun Personen. Es sind dies die Präsidentin und die Co-Präsidentin des Gesamtverbandes, sowie der/die Präsident/in, Co-Präsident/in oder Vize-Präsident/in der sieben Teilkonferenzen.

Aktuell setzt sich die Geschäftsleitung wie folgt zusammen:

Die Geschäftsleitung hat insbesondere folgende Aufgaben:

• Führung von Bildung Thurgau im Sinne des Zweckartikels
• Vorbereitung der Delegiertenversammlungen
• Ausführung der Beschlüsse der Delegiertenversammlung
• Besprechung der laufenden Geschäfte und deren Zuweisung an andere Organe
• Aufnahme von Anträgen der Teilkonferenzen und Kommissionen
• Koordinierung der Arbeit und des Budgets
• Erteilung von Aufträgen an die Teilkonferenzen und Kommissionen
• Einreichung von Anträgen an das Departement für Erziehung und Kultur
• Genehmigung der Weisungen und Pflichtenhefte
• Regelung der Anstellungsbedingungen der Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter sowie Genehmigung der Anstellungsverträge
• Wahl von Delegationen in kantonale oder schweizerische Gremien und Organisationen
• Aushandlung von Leistungsaufträgen mit dem Kanton
• Anlaufstelle für Medien
• Zusammenarbeit mit anderen Organisationen im Bereich Schule